Вильнев не хотел повторяться, поэтому Верметт должен был создать абсолютно новые декорации. Во второй части «Дюны» зрители увидят более глубокое погружение в футуристичный мир фильма, включая различные культуры и эстетику.
Задача Верметта состояла в оживлении этих пустынных пейзажей и создании новых декораций, отражающих каждую культуру. Он также должен был найти места для съёмок, которые бы дополняли атмосферу фильма.
Альтиволе, Италия
Когда Патрис прочитал сценарий продолжения, он сразу же подумал об одном необычном месте для садов планеты Империи Кайтайн и резиденции Императора. Он подумал о постмодернистском кладбище Бриона в итальянском городе Альтиволе. Это кладбище, как и сама гробница, было спроектировано архитектором Карло Скарпой, чьи работы повлияли на образы городов Каладан и Арракин в первом фильме, созданные Верметтом.
Съёмки видов Кайтайна проходили в саду вокруг гробницы. Внутренние сцены в начале фильма снимались внутри часовни на кладбище, хотя декорации для последующих сцен были построены в Будапеште.
Намиб, Намибия
Очень короткая сцена в фильме снималась в Намибии и представляет собой видение будущего пустынной планеты Арракис, которая только недавно наполнилась водой. По словам постановщика, Дени Вильнёв всегда мечтал о таком месте, где океан соединяется с песчаными дюнами. Такое место можно найти в Катаре и в Намибии. Для съёмок в Катаре им пришлось ждать приливов, а в Намибии океанские волны набегали одна за другой.
Хотя снятый там эпизод был коротким, он стал одним из наиболее обсуждаемых, поскольку в нём появилась Аня Тейлор-Джой в роли Али Атрейдес. До выхода фильма появление Тейлор-Джой держалось в секрете: её имя даже не было упомянуто в финальных титрах. «Лишь немногие из съёмочной группы отправились в Намибию. Мы подписали соглашение о неразглашении информации о том, что на нашем самолёте летела Аня Тейлор-Джой. Даже мои дети об этом не знали», – вспоминает Патрис Вермейт.
ОАЭ и Иордания
Съёмочная группа вернулась в Объединённые Арабские Эмираты и Иорданию, чтобы снять сцены в пустыне. Они выбрали места в Иордании для фонов, включающих каньоны, например, Аль-Сик. Основные эпизоды с дюнами снимались в Объединённых Арабских Эмиратах. В этот раз подход к съёмкам в пустыне сильно изменился. Для первой части привозили лишь реквизит. Однако для второй они создали несколько специальных локаций, что позволило им снять более масштабные эпизоды.
Будапешт, Венгрия
Как и в случае с первой частью «Дюны», декорации для второй снимались на площадках в Будапеште. Съёмки проходили между павильонами местного киностудий Origo Studios и выставкой Hungexpo. Размеры декораций в этом случае были на 40 % больше по сравнению с первой, показывая миры с большим количеством планет. Декорации, построенные на Hungexpo, включают в себя облик планеты Геди Прайм, который отличается мрачным монохроматическим дизайном и выпуклыми формами.